一般情况下，40天宝宝咳嗽如果症状较轻，可以给宝宝喝点水或是冰糖雪梨汤，宝宝咳嗽时可以轻轻拍拍后背帮助排痰；如果宝宝的症状较严重，可以在医嘱下喝一些小儿止咳药，比如小儿止咳糖浆或者鲜竹沥等；如果是细菌感染引起的咳嗽，可以在医嘱下服用小儿头孢克洛颗粒进行消炎；如果是咳嗽变异性哮喘引起的咳嗽，可以进行雾化治疗。

由于40天的宝宝太小，抗病能力较差，建议及时带宝宝去医院检查，明确病因后，在医生指导下积极进行治疗，以免延误病情，对宝宝造成一定伤害。