一般来说，怀孕43天药流通常是能流干净的，但部分孕妇也可能会流不全。药流是指药物流产，主要是服用特定的药物，来终止怀孕，适用于怀孕42-49天左右的孕妇，而怀孕43天在合理的范围以内，如果没有特殊情况，通常是可以流干净的，在服药后，要注意观察腹痛、阴道出血等情况。但部分孕妇可能对药物不敏感，或者发生过宫腔粘连，就可能会流不全，表现为出血量多，甚至会出现血块，此时，就要通过B超检查宫腔内的情况，必要时需要通过清宫手术处理。

在药流以后，要注意休息，避免熬夜，保持饮食清淡，避免吃辛辣刺激性的食物，多吃富含蛋白质的食物，以及新鲜的水果和蔬菜，同时要注意个人卫生，短时间内避免同房。