肚脐眼流水有臭味可能是不注意卫生、细菌繁殖、脐炎等导致的，具体如下：

1、不注意卫生：因为肚脐眼的结构是比较特殊的，里面有很多褶皱，是很容易隐藏污垢的。如果不注意个人卫生，或是洗澡的时候脏水留在肚脐眼里，没有清洗干净，就会在肚脐眼内发酵，而产生臭味。因此在平时的生活中要注意卫生，勤洗澡。

2、细菌繁殖：肚脐比较脆弱的部位，如果洗澡时把里面的所有脏东西都清洗干净，就可能会破坏肚脐的保护层，而导致细菌滋生，出现流水有臭味的情况。因此要避免肚脐眼细菌繁殖。

3、脐炎：脐炎主要表现为肚脐眼皮肤红肿、疼痛、瘙痒、有臭味、流水等，患者要及时就医，确诊后可以在医生的指导下外涂碘伏、龙胆紫、红霉素软膏等进行治疗。

除以上相对常见原因外，还有可能是脐尿管瘘等疾病导致的，建议患者及时就医，明确具体发病原因后，予以针对性治疗。