大拇指指甲隐隐作痛可能是指甲修剪过短引发甲沟炎，也有可能是甲周皮肤甲缘皲裂。具体如下：

1.甲沟炎：甲沟炎是甲周微小创伤或者嵌甲后，致病微生物感染所致的一种炎症。一般可以用棉签涂抹抗炎药膏红霉素软膏或者鱼石脂软膏等药物在患部周围，能够起到消炎的作用。建议平时指甲不要修剪过短，保持指甲的干净卫生。

2.甲周皮肤甲缘皲裂：当甲周皮肤甲缘皲裂，出现小裂口。也会引起大拇指指甲隐隐作痛，可以涂抹碘伏或者双氧水进行皮肤的消毒杀菌，还可以在医生的指导下外用涂抹抗炎药膏红霉素软膏、依诺沙星软膏等药物。