遵医嘱使用藕节和芦根煮水一般没有副作用，自行使用藕节和芦根煮水可能会有副作用。

1、没有：藕节味甘，性平，具有散瘀、止血的功效，常用于治疗咳血、吐血血痢等病症。芦根味甘，性寒，具有清热泻火、生津止渴的功效，常用于治疗热病烦渴、胃热呕吐、肺热咳嗽、肺痈、淋证等病症。患者遵医嘱服用的情况下一般没有副作用。

2、有：莲藕和芦根都属于寒性。如果自行使用，过量服用的情况下，可能会刺激胃肠道黏膜，导致腹痛、腹泻等胃肠道不适。此外，藕节和芦根具有清热凉血的功效，如果身体存在热性疾病，自行使用的情况下，可能会加重疾病的症状。

建议在日常生活中，注意饮食以清淡为主，避免进食辛辣刺激性的食物，如辣椒、生姜以及大蒜等。若有不适，需要及时到医院进行检查。