引起阴茎一阵一阵的刺痛的原因有很多原因，首先可能是因为海绵体损伤，可能是因为在性生活过程中用力较为粗暴、手淫频次过多致使海绵体出现损伤，就会表现为阴茎出现一阵一阵的疼痛，损伤的疼痛会更加剧烈，患者可以选择口服西地那非、他地那非等药物进行治疗，还可以对海绵体进行注射、真空负压吸引等方法，具体情况需要在医生的建议下选择适合的治疗方法，其次就是因为尿道炎引起的，尿道在阴茎内通过，尿道上皮有炎症的时候也会导致阴茎出现一阵一阵的疼痛，会表现在阴茎内，但还会出现尿急、尿频等现象，部分严重的患者，会伴随出现尿道口出现脓性分泌物，患者可在医生的指导下，口服红霉素、阿奇霉素等药物进行治疗。

患者生活中注意性生活的过程中需要带避孕套，防止细菌进行交叉感染，不要频繁的进行性生活，避免造成疼痛加重的现象，定时进行清洗，保持私处卫生的清洁、干燥，防止细菌的滋生等。