患者被辣椒呛到嗓子，一直有疼痛感，一般与生理性因素、急性咽炎、扁桃体发炎等有关，具体如下：

1、生理性因素：食用辣椒后会刺激咽喉黏膜，出现咽干、咽痛等症状，如果患者饮水后有好转，建议不必太担心，日常应避免食用辛辣食物，应多吃水果和蔬菜。

2、急性咽炎：与细菌入侵、饮食不当等有关，主要症状为咳嗽、咽痛、咽喉有灼热感等，患者可在医生指导下口服阿莫西林胶囊、头孢呋辛酯片、蒲地蓝消炎口服液等药物治疗，建议保护好喉咙，定期对室内通风。

3、扁桃体发炎：患者免疫力低下时，会感染病原菌，主要症状为咽痛、咳嗽、发热、食欲下降等，患者可根据医嘱，口服阿昔洛韦片、罗红霉素分散片、蓝芩口服液等进行治疗。

除上述常见原因外，还可能与疱疹等有关，建议患者选择正规医院进一步检查，不要太担心。