三个月的宝宝喝奶老是摇头可能是由于喂养姿势不正确、肠绞痛等原因造成的，具体情况如下：

1.喂养姿势不正确：可能是由于喂养姿势不正确导致宝宝吃不到奶或者吃奶比较费劲，不能够满足宝宝，所以导致宝宝喝奶老是摇头，宝宝在吃奶的时候要紧紧贴合乳头或者是奶嘴，这样吸奶会比较容易。

2.肠绞痛：可能是由于吞入大量空气、喂奶过量、外界刺激等原因造成的，通常会伴有腹胀、双腿向上蜷等症状，可以在医生的指导下使用颠茄片、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物进行治疗，如果病情没有得到缓解或者加重，建议及时到医院就医，遵循医嘱进行治疗。

家长注意观察宝宝的饭量，避免造成消化不良，保证宝宝的充足睡眠，促进宝宝成长发育，妈妈平时注意自己的个人卫生，喂奶期间不要喝酒、浓茶、咖啡等饮品，忌辛辣刺激的食物，如果是奶粉喂养，注意奶瓶的清洁卫生，按照配方冲泡奶粉。