通常情况下，颈动脉彩超和甲状腺彩超是不一样的。颈动脉彩超多用来明确患者是否存在颈动脉的狭窄、阻塞、颈动脉的血流等情况。而甲状腺彩超主要用来明确甲状腺的大小、形态等情况，同时还可以看是否有结节。另外，颈动脉彩超除了可以看甲状腺或颈部淋巴结，还可以看皮下软组织的增生以及部分肿瘤，而甲状腺彩超只是甲状腺局部的超声。所以这两者相比较而言，颈动脉彩超的范围更大。

患者具体应该做颈动脉彩超还是甲状腺彩超，一般要根据病情在医生的指导下做出决定。需要注意的是，颈动脉彩超是不能代替甲状腺彩超的，同样甲状腺彩超也不能代替颈动脉彩超。