男性染色体46xy一般是正常的，只有在男性染色体出现xxy、xx、xyy时，才是不正常的，因此患者不必过于担心。染色体是基因的载体，所以如果染色体出现异常，人体的发育也会出现异常。当男性染色体出现异常时，需要前往医院查明原因，如遗传、长期接触放射性物质等都可能会导致男性染色体异常。

染色体出现异常常会导致男性不育症，此时想要生育需要遵医嘱服用金匮肾气丸、六味地黄丸等药物治疗，或采用试管婴儿进行生育。此外染色体出现异还可能会造成生殖器发育异常，如隐睾、小睾丸、小阴茎等，需遵医嘱通过注射绒毛膜促性腺激素、尿促性素等方式进行治疗。