当阿米巴原虫感染初期会出现咳嗽、咳痰症状，主要表现为干咳或粘液脓痰，典型表现为巧克力状痰。原发的阿米巴性脑膜炎起病急，发展迅速。起初有头痛，发热，呕吐等症状，迅速转至谵妄，麻痹，昏迷，最快在一周内即可死亡。在阿米巴原虫感染神经系统时，神经系统症状表现为局灶性单侧损伤，伴严重局灶性坏死和水肿。患者头痛，发热，呕吐，颈部僵硬，头晕，嗜睡，精神错乱，共济失调直至昏迷甚至死亡。如为肺病急，胸膜阿米巴病常有畏寒发热(多为弛张热)，伴全身症状，如乏力、食欲减退。在阿米巴原虫感染引起肝脓肿穿孔的肺部，可以突然咳出大量棕褐色痰，日粘痰量可达500 ml以上，可有痰血甚至大咯血。胸膜休克是由于阿米巴原虫感染引起的肝脓肿穿孔，常伴有剧烈胸痛和呼吸困难，严重时可发生胸膜休克。建议有阿米巴原虫感染的患者，一定要积极的抗驱虫治疗为主，有发生其他病变的话，也要对症进行治疗。