恶露干净了又有褐色分泌物可能是子宫有残留或是宫颈炎、盆腔炎导致的，具体如下：

1、子宫有残留：子宫有残留的患者一般可以去正规的医院做B超检查，如果子宫有残留，可以通过清宫手术进行及时的处理，否则可能会诱发感染，还有可能会影响到以后的怀孕。另外患者在平时的生活中也要注意保暖，避免熬夜，不要吃一些富含蛋白质和维生素的食物，增强抵抗力，加快病情恢复。

2、宫颈炎：宫颈炎主要表现为阴道不规则出血、白带增多、白带有异味、腰腹部酸痛、性交疼痛、外阴瘙痒、灼热感等。患者一般可以在医生的指导下口服氧氟沙星、阿昔洛韦、阿奇霉素、米诺环素等进行治疗。

3、盆腔炎：盆腔炎主要表现为下腹部疼痛、阴道分泌物增多、阴道异常出血、发热、食欲减退等，患者一般可以在医生的指导下口服阿奇霉素、米诺环素、多西环素等进行治疗。

除以上相对常见原因外，还有可能是内分泌紊乱等导致的，建议患者及时就医，明确具体发病原因后，予以针对性治疗。