阴囊有小黑点，可能是色素痣所引起，也可能是阴囊湿疹、寻常疣等疾病所引起，一般可以通过药物、物理等方法进行治疗。

1、色素痣：通常与体内激素水平改变、外伤等因素有关，好发于身体任何部位，大多数为良性，一般不会出现其他症状，不必特殊处理。

2、阴囊湿疹：通常与环境潮湿有关，主要症状为阴囊瘙痒、红肿、脱屑、疼痛等，还可能导致局部色素沉着，在治疗上，可以谨遵医嘱涂抹炉甘石洗剂、曲咪新乳膏等药物。

3、寻常疣：通常是病毒感染所导致，好发于身体任何部位，可导致皮肤黑色素增加，可以通过激光、冷冻等方法去除。

除此以外，还可能是丝状疣、血管瘤、黑色素瘤等疾病所引起，建议及时到医院就诊，明确具体病因，对症治疗。