孕16周检查甲状腺并不晚。在怀孕期间，甲状腺功能对孕妇和胎儿的健康都非常重要，甲状腺激素水平的异常可能会影响胎儿的正常发育，尤其是神经系统和器官系统的发育。因此，及时检查甲状腺功能并采取相应的治疗措施是非常必要的。甲状腺功能检查可以帮助医生了解孕妇的甲状腺激素水平是否正常。如果甲状腺激素水平异常，及时治疗可以避免对孕妇和胎儿健康的影响。

一般来说，孕期甲状腺功能检查可以在怀孕12周后进行，孕16周检查并不晚。如果孕妇有甲状腺疾病史或家族史，或者出现甲状腺功能异常的症状，如疲劳、体重增加、心悸等，应尽早进行甲状腺功能检查。如果孕妇在孕期出现甲状腺功能异常，应及时就医并接受医生的治疗建议。