脚趾甲有两层，上层脱落可能是缺钙导致的，还有可能是外伤或者甲癣等引起的，具体如下：

1、缺钙：患者缺钙时，就可能会造成脚趾甲营养不良，出现脚趾甲有两层，上层脱落的症状，建议患者平时多吃些蛋白质丰富的食物，必要时在医生的指导下口服葡萄糖酸锌钙片或者碳酸钙等药物。

2、外伤：患者在脚趾甲受到外伤后，就可能会导致脚趾甲有两层，上层脱落的情况，建议平时避免磕碰或者挤压，注意休息。

3、甲癣：常见的症状有甲板增厚、分离、脱落、翘起等，可能伴有疼痛和出血。建议在医生的指导下外涂盐酸特比萘芬乳膏或者伊曲康唑胶囊等药物。

除此之外，脚趾甲有两层，上层脱落还有可能是甲剥离症引起的，建议患者及时到医院就诊。