子宫内膜异位症是一种常见的妇科疾病，其中子宫内膜组织在子宫腔以外的部位生长，如卵巢、盆腔、腹膜等处。这种异位的内膜组织会周期性地出血，从而引起疼痛和组织损伤。

患有子宫内膜异位症的女性仍然可以怀孕，但们的受孕率通常比正常女性低。这是因为子宫内膜异位症可能会干扰正常的排卵和受精过程。

巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种表现形式，当异位的内膜组织种植在卵巢上时，可能会形成囊肿，这些囊肿内含有深褐色的陈旧血液，类似于巧克力。患有巧克力囊肿的女性可能会遇到怀孕困难，但并非完全不能怀孕。

如果患有巧克力囊肿的女性怀孕，这可能对子宫内膜异位症有抑制作用，因此在某些情况下，医生可能会鼓励这些女性尝试怀孕。

对于那些有巧克力囊肿且怀孕困难的女性，可以考虑手术治疗。手术通常涉及切除囊肿，同时尽量保留卵巢，以改善内分泌环境。这种手术不仅可以去除囊肿，还可以改善受孕几率。

总的来说，子宫内膜异位症可能会影响怀孕，但并非绝对障碍。对于患有子宫内膜异位症的女性，医生会根据具体情况提供个性化的治疗建议，以帮助提高怀孕的可能性。