耳朵进水后疼可能是由于中耳炎引起的，也有可能是由于外耳道炎引起的，要找准病因，对症用药。具体如下：

1、中耳炎：主要症状有耳痛，耳渗液，耳流脓，鼓膜红肿，鼓膜穿孔流脓等。建议及时到医院就诊，在医生的指导下进行输液或者洗耳治疗，必要时采取手术治疗。

2、外耳道炎：症状主要表现为牵拉耳廓时会耳痒，耳道红肿，疼痛等。建议在医生的指导下用洗耳液清洗耳朵，并且服用头孢克肟分散片、盐酸左氧氟沙星片等抗生素类的药物进行治疗。

在日常生活中，患者要注意养成好的用耳习惯，洗澡洗头时注意保护好耳朵，不要再次进水，以免加重病情，不要熬夜，多休息，睡觉时尽量选择平躺，保持良好的心态，多喝热水，平时多吃水果蔬菜等，不要吃辛辣刺激的食物，定期到医院进行复查。