男性小便时痒一般考虑以下原因：

1、非淋球菌性尿道炎，主要原因为支原体、衣原体感染导致，患者在感染后会出现尿道瘙痒的症状，同时会出现尿道灼热，或是出现尿道内长期排出少许的分泌物。分泌物外观一般为黄色以及白色，主要呈现为稀薄状，并且能够结痂、干燥，糊住尿道口，部分患者会出现尿频、尿急、排尿疼痛等症状。大部分患者会有不洁性接触，若是出现相关症状建议进行支原体、衣原体的相关检查，在确诊以后选择对症的药物进行治疗。

2、淋病，主要患病原因为不洁性接触导致患者感染淋球菌，主要症状为尿道内瘙痒，并且伴有疼痛，尿道口会出现大量黄色脓性分泌物，大部分患者会出现尿频、尿急、排尿刺痛等症状。患者确诊需要进行淋球菌培养以及淋球菌涂片检查，患者在确诊后主要选择对症的药物进行治疗。此病也可通过性接触传播，所以治疗期间要禁忌性生活。