马钱子有清热解毒、兴奋神经、促进消化、抗菌等功效。马钱子味苦性寒。苦降泄火，寒能胜热。清热解毒，消肿止痛。适用于疯犬咬伤所致的恶水恶风，壮热止痛。比如《中医验方秘方》曰：“治狂犬病：马钱一粒，酒磨成粉，开水服之。马钱子所含的番木鳖碱对整个中枢神经系统具有兴奋作用，首先刺激脊髓的反射机能，然后刺激延髓的呼吸中枢和血管运动中枢，从而增强大脑皮层的感觉中枢功能。苦味强烈的番木鳖碱能刺激味觉感受器的反射，增加胃液的分泌，促进消化功能和食欲，患者的肠胃管试验表明，番木鳖碱对人体胃肠平滑肌无刺激作用。马钱子的水煎剂(1：2)在试管内对许兰氏黄癣菌、奥杜氏小芽胞癣菌有不同程度的抑制作用。离体实验表明，0.1%的马钱子碱对流感嗜血杆菌、肺炎双球菌、甲型链球菌和卡他球菌有明显抑制作用。