尿道口和肛门连接处肿痛可能是会阴炎症引起的，也可能是前列腺炎或肛周脓肿导致的，建议及时就诊治疗。具体如下：

1、会阴炎症：如果会阴部长时间处在潮湿的环境中，可能会存在细菌、真菌等病原体的感染现象，从而可能会导致上述症状，而且还可能会伴有瘙痒的情况。可以遵医嘱涂抹红霉素软膏、莫匹罗星软膏等消炎的药膏治疗，缓解疼痛。

2、前列腺炎：如果男性患者出现这种症状，也可能是前列腺炎导致的，可出现出现肿痛、尿急、尿痛的症状。可以遵医嘱是口服左氧氟沙星胶囊、阿莫西林胶囊等抗生素进行治疗，能够促进前列腺炎症的吸收。

3、肛周脓肿：一般是由于细菌侵袭肛门周围软组织导致的，患者会阴部一般会出现肿胀、按压疼痛等症状。可遵医嘱服用头孢克肟片、左氧氟沙星胶囊等药物进行抗炎治疗。情况严重时需要进行手术切开排脓治疗。

此外，尿道口和肛门连接处肿痛还可是混合痔导致的，患者可出现混合痔伴有血栓的症状，建议及时就医治疗，以免延误病情。