首先，二者的构成要素是不同的。

　　在红霉素软膏中红霉素含量为1%。辅助材料有：液体石蜡、白色凡士林。但红霉素眼膏中红霉素含量为0.5%。辅助材料有：液体石蜡，黄凡士林。因此二者的浓度有差异，同时红霉素眼膏中的白凡士林是经过完全漂白或部分漂白的黄凡士林，刺激性大于黄凡士林。

　　二是两种药物的分类不同。

　　红霉素软膏属于乙类非处方药，不需药师指导即可购买使用。红霉素眼膏是一种甲类非处方药，必须在药店的执业药师或药师指导下购买使用，毕竟眼膏剂要去特殊使用。

　　三是两者对质量的要求标准不同。

　　红霉素眼膏属于外用皮肤制剂，而红霉素眼膏属于眼用制剂。这说明红霉素眼膏绝不能代替红霉素眼膏。不然会导致严重的眼睛感染。

　　四是两者针对的适应证不同。

　　红霉素软膏可用于：化脓性皮肤病，如脓疱疮，小面积烧伤，溃疡面感染或痤疮。使用方法：取红霉素软膏适量，涂抹患处，一天2次。

　　红霉素眼膏可用于：沙眼、结膜炎、睑缘炎、眼外炎等;用法用量：涂抹于睑内处2~3次，每次2~3次，每次1~2次。