患者做肠镜后肚子不舒服的情况，可能是气体刺激、肠道糜烂等引起的，也可能与直肠炎等有关，建议明确病因，对症治疗。

1、气体刺激：一般做肠镜时，会在肠管里打气，将肠壁撑开，由于肠道对机器相对敏感，操作结束后，患者会出现肚子痛等不适症状，一般平躺后会有所减轻，属于正常的生理现象，建议不要太紧张。

2、肠道糜烂：与细菌感染、不良饮食习惯等有关，如果肠道内出现糜烂，患者会出现肚子疼、大便次数增加等情况，做肠镜后，可能会加重不适感，建议患者在医生指导下口服柳氮磺吡啶肠溶片、地塞米松片等药物进行治疗。

3、直肠炎：是指直肠内出现炎症，主要症状为肚子痛、肚子胀气、腹泻等，患者可以在医生指导下口服肠炎宁片、蒙脱石散等药物进行治疗。日常饮食要清淡，多喝热水，避免激烈运动。

除上述常见原因外，还可能与泌尿系统感染等有关，建议选择正规医院进一步检查。