脸上有肉色突起小疙瘩可能是寻常疣或是皮脂腺囊肿等导致的，具体如下：

1、寻常疣：寻常疣是由于人乳头瘤病毒感染到皮肤黏膜所引起的良性增生性的疾病。寻常疣可以发生于身体的任何部位，一般表现为蚕豆大小的隆起、可以呈菜花状、乳头瘤状等，可多发也可单发。患者一般可以在医生的指导下使用咪喹莫特乳膏、酞丁胺乳膏等进行治疗，还可以使用激光或是手术的方式去除寻常疣。

2、皮脂腺囊肿：皮脂腺囊肿是由于皮脂腺分泌的油脂未能正常的从毛囊口进行排出，而在体内聚集而形成的囊肿。小的囊肿一般没有非常明显的症状，而大的囊肿可能会因为压迫到了周围的神经或是组织而造成疼痛或不适等。皮脂腺囊肿一般还可以通过手术的方式进行切除。