一般情况下，孕39天有可能看见孕囊，但也存在看不见的可能。

如果女性月经周期规律，周期在28-30天左右，孕39天通过阴道超声检查，有可能看见孕囊。但如果月经周期较长，受孕时间较晚，孕39天可能看不到孕囊。这是因为孕囊的出现时间与受精卵着床时间有关，着床晚则孕囊出现也会相对晚些。

如果在孕39天看到了孕囊，孕妇要注意多休息，避免剧烈运动和性生活，防止流产。饮食上要保证营养均衡，多摄入富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，如蛋类、奶类、新鲜蔬果等。如果此时未看到孕囊，孕妇也不必过于焦虑，可在1-2周后复查超声。在此期间，若出现腹痛、阴道流血等异常情况，应及时就医。

孕期是一个特殊时期，孕妇要保持良好的心态，定期产检，密切关注自身和胎儿的健康状况，积极配合医生做好各项检查和保健措施。