咬紧牙关时一侧耳朵疼可能是由于外耳道炎引起的，也有可能是由于下颌关节炎引起的，要找准病因，对症用药。具体如下：

1、外耳道炎：常见症状表现为牵拉耳廓时会有疼痛，耳痒，耳道红肿等。建议在医生的指导下用洗耳液清洗耳朵，同时口服头孢克肟分散片、盐酸左氧氟沙星片等抗生素类的药物，并定期到医院进行复查。

2、下颌关节炎：常见症状有关节局部酸胀或疼痛、关节弹响、下颌运动障碍等，可能会伴有压痛。建议在医生的指导下服用阿莫西林、阿奇霉素等药物进行治疗。

患者在日常生活中要注意保护好耳朵，不要压到耳朵，也不要用力拉扯耳朵，清淡饮食，不要吃辛辣油腻刺激的食物，平时多吃水果蔬菜等，提高免疫力。