小弟根部也就是临床上的阴茎根部，阴茎根部长小水泡的原因一般可能是与生殖器疱疹、包皮龟头炎、过敏等情况有关，具体情况如下：

1、生殖器疱疹：生殖器疱疹通常可能是与性接触传播有关，从而疱疹病毒就可能会感染生殖器和肛周皮肤粘膜，从而导致阴茎根部长出小水疱，并且有些患者还可能会伴有疼痛，可以在医生的指导下选择口服阿司匹林、对乙酰氨基酚、阿昔洛韦、伐昔洛韦等药物进行治疗。

2、包皮龟头炎：包皮龟头炎的临床症状一般可能会表现为尿痛、尿频、瘙痒等，可以在医生的指导下选择口服盐酸左氧氟沙星胶囊、阿奇霉素分散片等药物进行相关的治疗。

3、过敏：如果患者出现了过敏的情况，不仅会出现水泡的情况，还可能会伴有瘙痒，可以在医生的指导下选择口服氯雷他定片、盐酸西替利嗪片等药物。

除了上述疾病，还可能是张力性水泡有关，需要及时去往医院进行诊治。