阴茎根部起小疙瘩可能是不注意个人卫生引起的，还有可能是湿疹或者尖锐湿疣等疾病引起的，具体如下：

1、不注意个人卫生：患者不注意个人卫生就可能会出现阴茎根部起小疙瘩、阴茎瘙痒等症状，建议患者平时勤洗澡，养成良好的卫生习惯。

2、湿疹：主要表现为小丘疹或者水疱，还可能会伴有瘙痒、渗液等症状，建议患者在医生的指导下口服盐酸奥洛他定片或者湿毒清胶囊等药物。

3、尖锐湿疣：患者外阴可能出现一些比较小的乳头状的赘生物，常伴有疼痛或者发痒的感觉，还可能会出现性交不适、出血等症状。建议患者在医生的指导下通过氟尿嘧啶软膏以及鬼臼毒素酊等药物进行针对性的治疗。

除此之外，皮脂腺囊肿也有可能会导致阴茎根部起小疙瘩，建议患者及时到医院就诊，根据具体病因进行治疗。