慢性结直肠炎可能需要数周到数月左右的时间才能治疗好。由于慢性结直肠炎往往会反复发作，并呈呈现慢性过程，所以治疗时间是有一定差异的，具体情况因人而异。治疗上一般需要在医生的指导下应用抗感染药物或应用糖皮质激素、水杨酸制剂进行治疗，经过积极治疗后，大多数慢性结直肠炎患者是能够达到治愈状态的。

当然由于病情容易反复，所以在病情缓解之后，也要注意预防，加强日常生活的护理。建议饮食上应食用易消化的半流质、少渣食物，并做到少食多餐，禁止吃有刺激性、油腻、高脂肪、生冷的食物，并禁烟、禁酒。同时日常中应加强锻炼，增强体质，有利于身体健康。