阴茎上有小疙瘩不痛不痒可能是毛囊炎、尖锐湿疣、皮脂腺异位症等导致的，具体如下：

1、毛囊炎：毛囊炎主要表现为皮肤瘙痒、触痛、发红、丘疹、脓疱、发热、头痛等，患者一般可以在医生的指导下外用酮康唑乳膏、咪康唑霜、益康唑乳膏等进行治疗。

2、尖锐湿疣：尖锐湿疣主要表现为皮肤粗糙、下体异物感、皮肤瘙痒、肛门新生物、丘疹等，患者一般可以在医生的指导下外用三氯醋酸、咪喹莫特、鬼臼毒素酊等进行治疗。

3、皮脂腺异位症：皮脂腺异位症主要表现为凸起的扁平丘疹、瘙痒、疼痛等，患者一般可以在医生的指导下外用他克莫司软膏、吡美莫司乳膏、维A酸乳膏等进行治疗。

除以上相对常见原因外，还有可能是龟头炎等原因导致的，建议患者及时就医，明确具体发病原因后，予以针对性治疗。