孕晚期有霉菌感染时，通常是可以塞药的，但也存在特殊情况。

一般情况下，孕期女性体内激素水平变化，阴道环境改变，容易发生霉菌性阴道炎。如果症状较轻，可先通过局部护理缓解，如勤换内裤、保持外阴清洁等。若症状严重，如出现明显瘙痒、白带异常增多等，在医生指导下选择合适的药物塞药治疗是可行的，这能有效控制病情，减少对孕妇和胎儿的不良影响。不过，若孕妇有早产迹象或其他特殊情况，医生可能会综合评估后谨慎用药或先采取其他措施。

孕期用药需谨慎，一定要遵循医生的建议。如果确诊为霉菌性阴道炎，不要自行用药，以免影响胎儿健康。同时，要注意个人卫生，保持良好的生活习惯，积极配合医生治疗，这样才能保障自身和胎儿的健康。