龟头一边大一边小，有时候有点疼，可能是蚊虫叮咬导致的，也可能是局部外伤、龟头炎等因素导致的，建议患者及时到医院就诊，确诊后对症治疗。

1、蚊虫叮咬：蚊虫叮咬通常是一些小飞虫通过其口器刺伤患者皮肤导致的，会使患者的皮肤出现红肿、疼痛或瘙痒等症状，如果患者的龟头部位不小心被蚊虫叮咬了，那么就可能会由于肿胀而表现的大小不一，建议在医生指导下使用炉甘石洗剂、红霉素软膏、无极膏等进行缓解。

2、局部外伤：当患者的龟头部位不小心碰伤时，也可能会出现肿胀的现象，由于损伤程度不一，所以肿胀也会有轻有重，患者可以在医生指导下使用夫西地酸乳膏、金霉素软膏、莫匹罗星软膏等药物进行治疗。

3、龟头炎：龟头炎是龟头部位受感染、外伤等因素影响而出现的炎症，常伴随龟头红肿、疼痛、溃疡等症状，患者可以在医生指导下使用盐酸特比萘芬乳膏、克霉唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏等药物进行治疗。

除了以上常见因素之外，龟头一边大一边小，有时候有点疼，还可能与阴茎癌有关，不过比较少见，患者可以尽快就医检查排除风险。