一般情况下，便标本肛拭子约留取粪便3~5克，需要时可肛拭子采纳，放入湿润、干净、无吸水性的有盖容器内，贴好标识送检，细菌检讨的便标本应该收集在灭菌封口的容器内，不要混入消毒剂以及其他的化学药品。盛便标本的容器必须有盖，有显著标识表记标帜，要拔取便的脓、血、粘液等平常成分进行检讨，采纳标本后实时送检，不然可因PH及消化酶影响，而使便中细胞成分损坏分化。

如果不能立即检查，应该将便标本放入4℃以下保存和带冰运输。如果需要长期保存的标本，应该加入少量防腐剂冰冻保存。