两个月宝宝三个小时没小便可能是生理因素引起的，也可能是先天性尿道畸形或膀胱炎导致的，建议及时就诊治疗，具体如下：

1、生理因素：如果天气过于炎热，宝宝穿衣过厚，导致出汗量多，可能会出现两个月宝宝三小时没小便的现象。其次，如果正在哺乳的女性饮水量较少，导致乳汁中的水分含量低，从而导致宝宝进水量少，也可能会出现这种情况。建议哺乳期母亲适当多喝水，天气炎热时可以使用奶瓶给宝宝喂水;

2、先天性尿道畸形：可能是先天发育异常、遗传因素等引起先天尿道畸形，造成尿路梗阻，尿液无法正常排出，导致两个月宝宝三个小时没有小便。确诊后可以通过插尿管来帮助排尿，必要时可采用尿道扩张术、尿道畸形矫形术来治疗。

3、膀胱炎：可能是不注意宝宝的外阴卫生，导致细菌在尿道口滋生，当细菌逆行进入膀胱时，在膀胱内大量繁殖，引起膀胱炎，炎症渗出粘连尿道，容易导致尿液无法正常排出，同时还可出现尿频、尿急、尿痛等症状。确诊后应遵医嘱使用阿莫西林颗粒、头孢克肟片等药物治疗。平时应注意保持外阴卫生，勤更换、清洗内裤。

此外，两个月宝宝三个小时没小便还可能是肾功能受损导致的，建议家长及时带宝宝就医，并积极治疗，以免延误病情。