13岁男孩内裤上有黄渍，可能与不注意卫生有关，也可能是龟头炎、尿道炎等疾病所导致，一般可以通过药物等方法进行治疗。

1、不注意卫生：如果经常不清洗局部，也不勤洗勤换内裤，就可能使尿液在内裤上残留，出现发黄的污渍，需要注意个人卫生，勤更换内裤。

2、龟头炎：通常是细菌感染所引起，由于炎性物质增多，就可能遗留在内裤上，可导致内裤发黄，伴有瘙痒感，在治疗上，可以谨遵医嘱涂抹莫匹罗星软膏、红霉素软膏等药物。

3、尿道炎：通常与饮水过少有关，可导致内裤出现黄色污渍，伴有尿频、尿痛等症状，可以在医生的指导下服用头孢克肟颗粒、阿奇霉素片等药物治疗。

除此以外，还可能是膀胱炎、前列腺炎、淋病等原因所导致，建议及时到医院就诊，明确具体病因，避免耽误治疗。