阴茎上长水疱，可能与过敏有关，也可能是湿疹、龟头炎等原因所导致，一般可以通过药物的方式进行治疗。

1、过敏：通常与接触过敏原有关，好发于皮肤任何部位，主要症状为局部瘙痒、红肿、灼热、疼痛等，严重时还可能出现水疱，可遵医嘱服用氯雷他定片、盐酸左西替利嗪片等药物治疗。

2、湿疹：通常与环境潮湿有关，好发于面部、背部、生殖器等部位，局部可出现丘疹或丘疱疹，可以在医生的指导下涂抹他克莫司软膏、吡美莫司乳膏等药物治疗。

3、龟头炎：通常与外伤有关，主要症状为龟头红肿、瘙痒、糜烂等，严重时还可能出现渗液和水疱，在治疗上，可以谨遵医嘱涂抹复方克霉唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏等药物。

除此以外，还可能是生殖器疱疹、带状疱疹、尖锐湿疣等原因所导致，建议及时到医院就诊，明确具体病因，对症治疗。