更年期吃叶酸的副作用一般包括胃肠道不适、贫血、免疫系统受损等，但这些副作用并不是所有更年期女性都会出现，而且叶酸的副作用通常与剂量过大有关。

1. 胃肠道不适：如果服用过量的叶酸，或者由于叶酸中的铁元素和镁元素对胃黏膜造成刺激，可能会导致胃肠道不适。

2. 贫血：可能是由于叶酸缺乏导致红细胞形成障碍，或者是由于叶酸片的剂量过大导致铁元素流失，进而导致贫血。

3. 免疫系统受损：过量的叶酸摄入会干扰免疫系统中的细胞信号转导途径，从而影响免疫细胞的功能。此外，叶酸过量还会干扰抗氧化系统的功能，进而导致免疫功能受损。

除以上副作用外还有失眠、喉咙肿胀、呼吸困难等，因此，女性在更年期应该注意控制叶酸的摄入量，避免过量摄入。建议每天摄入的叶酸量不超过400微克。如出现不良反应建议及时就医，避免耽误治疗。