在一般情况下，抗原检测指的是新型冠状病毒抗原检测。自测新型冠状病毒抗原检测第一次阳性，第二次阴性可能是操作不当或者样本被污染等原因造成的，也有可能是感染了新型冠状病毒，要根据具体的情况进行处理。

1、操作不当：如果自测新型冠状病毒抗原检测是第一次操作，由于操作不规范，可能会导致检查结果不准确，需要进行复核，根据说明书进行操作。

2、样本被污染：在操作过程中，采取的样本在空气中暴露时间过长或者被其他物质污染，也会导致新型冠状病毒抗原检测结果出现异常，所以在采样过程中一定要严谨的操作。

3、感染了新型冠状病毒：如果患者感染了新型冠状病毒，在进行新型冠状病毒抗原检测时就会出现阳性的结果，通过及时正确治疗，体内病毒排除干净，第二次做新型冠状病毒抗原检测时就会出现阴性的情况，说明疾病已经好了。