物种不同：茯苓是一种寄生菌，常寄生于松树根部，中草药用此菌种的干菌核。土茯苓是一种多年生常绿攀缘灌木，其根内结有块状根茎，是土茯苓的主要入药成分。成分不同：茯苓的主要成分是热量、硫胺素、钙、蛋白质、核黄素、镁、脂肪、烟酸、铁、碳水化合物、维生素C、锰、膳食纤维、维生素E、锌、维生素A、胆固醇、铜、胡罗卜素、钾、磷、视黄醇、钠、硒。土茯苓的主要成分是根茎含皂甙、鞣质、树脂、落新妇甙、异黄杞甙、琥珀酸、胡萝卜甙、棕榈酸、β-谷甾醇，以及生物碱、挥发油、糖、甾醇、淀粉等。 功效不同：茯苓味甘、淡，性温。归心肺脾肾经利水渗湿，健脾，宁心。适用于水肿尿少，痰饮眩悸，脾虚食少，便秘泄泻，心神不安，惊厥失眠。土茯苓甘、淡，平。归肝、胃经。解毒，除湿，通利关节。用于水银中毒和梅毒引起的肢体痉挛、筋骨疼痛、湿热淋浊、带下、疮疡、疥癣等。食用方法不同：由于茯苓多糖、蛋白质、氨基酸含量较高，所以茯苓经常被做成茯苓饼、茯苓酥和茯苓酒等食品。土茯苓大多数作为中草药使用，不怎么用于食用，由于土茯苓有药味，严重影响食用价值，吃法仅限于需要中药味道的菜肴类，如：土茯苓炖龟。