半边咽喉肿痛吞口水都疼，可能是急性扁桃体炎、急性咽炎等引起的，建议及时去医院就诊，查明原因，在医生的指导下治疗，具体如下：

1.急性扁桃体炎，一般起病急，表现为咽喉肿痛、畏寒、高热等症状。需要注意休息，多饮水，进流食，加强营养。可以在医生的指导下，使用抗生素药物治疗，比如阿莫西林、罗红霉素等，也可以应用解热镇痛的药物，比如阿司匹林、布洛芬等。平时注意控制饮食，少吃辛辣刺激性食物，戒烟戒酒，加强锻炼，增强体质。

2.急性咽炎，是发生在人体咽部黏膜、黏膜下组织和淋巴组织的急性炎症，可以使用呋喃西林溶液或复方硼砂溶液等含漱，缓解咽喉不适症状。如果是细菌感染的，要合理口服抗生素治疗，比如阿奇霉素、阿莫西林等；如果是病毒感染的，可选用抗病毒药物治疗，如病毒灵、蒲地蓝消炎口服液等。