扁桃体发黑的情况一般可能与慢性扁桃体炎有关，也可能与食物的颜色残留有关，还可能与扁桃体囊肿有关。

1、慢性扁桃体炎多由急性扁桃体炎反复发作转为慢性，病原菌以链球菌及葡萄球菌等最常见。临床表现为经常的咽部不适，异物感，可能会伴有发干、痒、口臭等症状。可以在医生的指导下选择口服蓝芩口服液或金嗓子喉片等。

2、食物颜色的残留也可能会导致扁桃体发黑的情况发生，一般不会伴随其他症状，可以通过多喝白开水来进行缓解，通常不需要特别处理。

3、扁桃体囊肿是扁桃体常见的良性肿瘤。扁桃体表面会有很多正常存在的隐窝，如果扁桃体小窝口分泌物潴留，扁桃体囊肿就自然形成了，扁桃体囊肿属良性疾患，咽部无异物感时不需要特别处理，观察即可，如果一直不变，那么就一直不需要处理。如果短期内发现其增生明显，则需要及时处理，可以考虑做等离子扁桃体切除术和囊肿切除术来治疗。

如果有扁桃体发黑的情况，可以及时去往医院进行检查。