早上起床龟头有透明分泌物可能是生理性因素导致的，也可能是尿路感染或前列腺炎引起的，建议及时就诊治疗。具体如下：

1、生理性因素：如果早上出现晨勃或是性兴奋，可能会有前列腺液流出，一般呈透明状，所以可能导致上述症状的出现，这是正常的生理现象，无需过度担心，也不需要进行特殊处理。

2、尿路感染：如果患者的泌尿系统受到细菌、真菌等病原菌侵入，可能会引起炎症反应。在炎症反复刺激下可能会导致前列腺液分泌，从而出现这种症状，同时还可伴有尿频、尿急、尿痛等症状。

3、前列腺炎：通常是由于病原体感染，以及不洁性生等因素所引起。因炎症刺激导致前列腺分泌液体，所以可能会出现早上起床龟头有透明分泌物的症状。同时患者还可能会出现疼痛、早泄等症状。

此外，少数情况下早上起床龟头有透明分泌物还可能是淋病导致的，患者可出现尿道口灼热、发痒的症状，建议及时就医，明确病因后积极治疗。