早期肛门癌的症状包括：粪便变细或变形，常伴有粘液或脓血。由于分泌物对肛周皮肤的刺激，患者会肛门瘙痒。分泌物伴腥臭味。肛门疼痛也是肛门癌的主要症状，初期只是轻微疼痛，随着病情加重会产生持续疼痛，便后更明显。直肠指检或肛镜检查均见肛管内溃疡型肿块或息肉样、蕈状肿块，亦有浸润型肿块伴肛管缩窄。后期会逐渐形成溃疡，局部有触痛，其分泌物稀薄，常混有血丝。溃疡底有灰白色的坏死组织，周围有外翻和颗粒状结节，易结痂出血。肛门癌病者就诊时常多见一侧或双侧腹股沟淋巴结肿大，多发、质韧实或伴有疼痛。诊断主要依据组织病理学及肛窥器检查结果，根据病史及临床表现。对确诊早的患者应及时选择手术治疗，避免发生远处转移，晚期患者还可出现贫血和低蛋白血症，甚至合并肠梗阻。