痔疮手术后肛门还有两块肉可能是局部水肿或是手术残余等导致的，具体如下：

1、局部水肿：水肿是痔疮手术后常见的短期并发症，可以在肛缘和肛管皮肤出现隆起、充血，从而引起疼痛、肿胀等症状。这种水肿一般是不需要特殊处理的，会随着伤口的慢慢愈合而逐渐消除，而如果患者的水肿比较大不能完全消除或是影响到了伤口的愈合，则可以去医院找医生进行复查，必要时可以在局麻下进行切除。

2、手术残余：痔疮手术后肛门有可能是结扎的痔核根部残端，这种情况一般是不需要进行处理的，随着时间的推移可以逐渐萎缩。