无痛胃肠镜副作用主要有恶心、呕吐、腹胀、全身乏力、头晕、站立不稳、注意力下降等，部分患者还可能会出现皮肤瘙痒、皮疹、心跳过快等过敏的副作用，严重时还可能会导致心跳停止，但是由于患者的自身体质不同，医生的技术水平也存在差异，所以具体的副作用是因人而异的。

在日常生活中，患者在做完无痛胃肠镜之后，要尽量选择卧床休息，不要进行剧烈运动，同时饮食上要注意营养均衡，不要吃过于辛辣、生冷等不易于消化的食物，注意个人卫生，保持愉悦的心情，身体出现异常情况要及时前往医院就诊。