生殖器有疙瘩不痛不痒，可能与皮脂腺囊肿有关，也可能与毛囊炎、尖锐湿疣等原因有关，具体如下：

1、皮脂腺囊肿：主要是皮脂腺腺管堵塞所引起，可能会形成小疙瘩，但通常没有症状，既不痛也不痒，在这种情况下，不必特殊治疗，注意观察即可，如果皮脂腺囊肿逐渐增大，建议通过手术的方式进行切除。

2、毛囊炎：如果平时不注意卫生，导致细菌感染，引起毛囊炎，刺激局部，就可能会出现小疙瘩，但炎症并不明显，通常没有疼痛、瘙痒等症状，在治疗上，可以谨遵医嘱涂抹红霉素软膏、莫匹罗星软膏等药物。

3、尖锐湿疣：通常是人乳头瘤病毒感染所引起，主要表现为局部有红色的丘疹，随着病情的发展，可能会逐渐增大，但在患病早期，通常没有症状，在治疗上，可以谨遵医嘱涂抹咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等药物，如果症状比较严重，可以通过激光的方法进行去除。

除此以外，还可能与扁平疣、宫颈腺囊肿等原因有关，建议患者明确具体病因，对症治疗。