同房后阴囊隐隐作痛可能是阴囊皮肤炎症导致的，也可能是睾丸炎或精索炎引起的，具体如下：

1、阴囊皮肤炎症：如果阴囊皮肤有炎症，在进行同房时摩擦刺激可能会导致局部炎症刺激加重，导致上述症状。同时还可有红肿、瘙痒等症状。

2、睾丸炎：当睾丸附睾有炎症时，局部可能会有肿胀、疼痛等症状，同房可能会导致睾丸附睾分泌功能增强，而且可能会会导致局部病变部位受到刺激，进而出现同房后阴囊隐隐作痛的情况。

3、精索炎：如果精索出现炎症，局部可能会有充血水肿，同房可能会使局部肌肉出现收缩，从而可能会加重精索部位的炎症刺激，从而出现这种症状。

此外，同房后阴囊隐隐作痛还可能是精索静脉曲张导致的，患者可出现静脉血反流、红肿等症状，建议及时就医，明确病因后积极治疗。