黄芩有燥湿清热、泻火解毒、止血抗菌等功效。黄芩苦寒，能清肺胃、肝胆、大肠的湿热，可以用来治疗湿温或者暑湿初起，表现为身热不扬，胸脘痞闷，舌苔黄腻等症;也可用于治疗湿热中阻，痞满呕吐，湿热泻痢，湿热黄疸等症。黄芩主入肺经，能清肺热，是治疗肺热咳的重要药物。另外，黄芩还可清气分实热，且有退热之效，可用于外感热病，伤热烦渴，尿赤便秘等症。水煎剂黄芩醇沉液、黄芩苷、黄芩总酮等均具有明显的解热作用。黄芩具有清热泻火解毒的功效，可用于治疗痈肿疮毒，常与黄连，黄柏，栀子等同用。黄芩有清热泻火，凉血止血的作用，可用于治疗热迫性妄行所致的吐血、呕血等，亦可用于治疗血热便血、痔疮出血等症。对金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、肺炎双球菌等革兰氏阳性菌和大肠杆菌、痢疾杆菌、绿脓杆菌等革兰氏阴性菌，黄芩煎液体外均有不同程度的抑制作用;对甲型流感病毒和乙型肝炎病毒，黄芩煎液外水浸出物也有不同程度的抑制作用。