可以将木瓜去皮去籽，直接食用，也可以榨汁或是搭配其他水果食材一同榨汁饮用;还可以用于煮汤，熬粥或是炖煮食用。木瓜营养丰富，果实中含有丰富的胡萝卜素，蛋白质，钙盐，苹果酸，酒石酸，柠檬酶和维生素，有健脾消食，清心润肺的功效，其中的木瓜蛋白酶可以将脂肪分解，有助于蛋白质消化，促进肠胃对食物消化吸收。木瓜中的凝乳酶有通乳作用，木瓜果肉中含有的番木瓜碱具有缓解痉挛疼痛的作用，对腓肠肌痉挛有明显的治疗作用。但是木瓜中的番木瓜碱，对人体有小毒，所以每次食量不宜过多，过敏体质者更要慎吃。不能和海鲜一起吃，同吃会上火。木瓜不能和油炸食物一起吃，会引起肠胃不适，并可能导致腹泻、呕吐。孕妇不宜吃木瓜，会引起子宫收缩、腹痛。