姨妈一般指的是月经，连续两个月月经只有两天可能是子宫内膜异位症、卵巢囊肿或是甲状腺功能减退症等导致的，患者可以通过药物或手术的方式进行治疗。

1、子宫内膜异位症：主要表现为经血量增多、腹痛、性交痛、排便困难、便秘、腹泻、不孕等，患者一般可以在医生的指导下口服阿司匹林、吲哚美辛、塞来昔布等进行治疗。

2、卵巢囊肿：主要表现为月经异常、疼痛、下腹部肿块、尿频、尿急、便秘等，患者一般可以通过手术进行治疗。

3、甲状腺功能减退症：主要表现为疲乏、体重增加、便秘、皮肤干燥、头发稀疏、心率减慢等，患者一般可以在医生的指导下口服雷替斯、优甲乐等进行治疗。

除以上相对常见原因外，还有可能是卵巢早衰、子宫内膜息肉、慢性肝病等原因导致的，建议患者及时就医，明确具体发病原因后，予以针对性治疗。