复发性口腔溃疡的主要病因并不明确，但是科学文献证明，它与以下几种原因存在相关性：

　　首先，最常见的就是由于体内缺乏维生素C引起，一般也是由于上火引起，其次，可能是由于患者内分泌系统的变化，除此之外，口腔溃疡还可能是家族遗传，还有一种可能是复发性阿弗他溃疡，属于一种自身免疫性疾病。另外，口腔溃疡还有可能是咬合导致的，比如蛀牙或牙体缺损，长期磨耗牙周的黏膜，从而导致口腔溃疡的发生;患者如果经常吃辛辣刺激的的食物也容易导致口腔溃疡;还与患者的精神因素有关，如果患者的心态不好、工作压力大、心理负担重，很有可能会患上这一类的疾病;口腔溃疡也与患者的休息有关，如果患者的工作繁忙、睡眠不足，很有可能导致这类疾病的发生。